Markus Ellensohn erhielt mit 8 Jahren seinen ersten Violinunterricht bei Elmar Mayer, einem Gründungsmitglied des Orchestervereins Götzis. Anschließend war er Schüler an der Musikschule Mittleres Rheintal bei Ildikó Horváth und an der Musikschule Dornbirn bei István Hodász. Er war mehrfacher Preisträger beim Wettbewerb „Jugend musiziert“ und sammelte erste Orchestererfahrungen als langjähriges Mitglied des Jugendsinfonieorchesters Dornbirn und des Collegium Instrumentale Dornbirn unter der Leitung von Prof. Guntram Simma.
Nach der Matura am BORG Götzis studierte er Englisch und Musikerziehung an der Pädagogischen Akademie in Feldkirch und Violine am Landeskonservatorium für Vorarlberg bei Prof. Rudolf Koelman und Prof. Roland Baldini. Seine Studien schloss er jeweils mit dem Lehrdiplom ab und begann 1990 seine Tätigkeit als Pädagoge. Er absolvierte eine Zusatzausbildung in Kulturmanagement an der Deutschen Akademie für Management in Berlin und ein Aufbaustudium an der Pädagogischen Hochschule Vorarlberg.
Seit 1991 ist Markus Ellensohn ständiges Mitglied des Symphonieorchesters Vorarlberg, konnte umfassende Erfahrungen als Orchestermusiker sammeln und mit internationalen Spitzendirigenten zusammenarbeiten. Eine rege Konzerttätigkeit mit verschiedenen professionellen Orchestern und Ensembles in Österreich, Deutschland, der Schweiz und im Fürstentum Liechtenstein ergänzen seine musikalischen Aktivitäten. Im Jahre 2004 übernahm er die musikalische Leitung des Orchestervereines Götzis.
Er unterrichtete 10 Jahre an der Musikmittelschule Bregenz und 23 Jahre an der Rheintalischen Musikschule Lustenau und war 16 Jahre als Mentor für Lehrpraxis Violine am Landeskonservatorium für Vorarlberg/Stella Vorarlberg Privathochschule für Musik tätig. Seit September 2024 ist er Direktor der Musikschule Rankweil-Vorderland.